法人の各事業年度開始の日前10年^※以内に開始した事業年度において生じた欠損金（青色欠損金）は、以下の金額を限度として、その各事業年度の所得金額の計算上損金の額に算入される。

• 2017年4月1日から2018年3月31日までに開始する事業年度：所得金額の55％
• 2018年4月1日以後開始する事業年度：所得金額の50％

ただし、以下の法人については、各事業年度の所得金額の全額が青色欠損金の損金算入額の限度とされる。

• 中小法人（事業年度終了の時において資本金の額が1億円以下である普通法人（資本金の額が5億円以上である法人にその発行済株式の全部を保有されているもの等を除く。）（2.において同じ。）
• 特定目的会社等（特定目的会社又は投資法人等で、支払配当等の損金算入制度の適用対象となるもの）
• 更正手続開始の決定等の事実が生じた法人・・・その決定等の日から更生計画認可の決定等の日以後7年を経過する日までの期間内の日の属する各事業年度（金融商品取引所への再上場等があった場合には、その再上場された日等以後に終了する事業年度は除く。）に限る。
• 新設法人（資本金の額が5億円以上である法人にその発行済株式の全部を保有されている法人、株式移転完全親法人等は除かれる。）・・・法人の設立日から同日以後7年を経過する日までの期間内の日の属する各事業年度（金融商品取引所に上場された場合等には、その上場された日等以後に終了する事業年度は除く。）に限る。

この制度は、欠損金の生じた事業年度について青色申告書である確定申告書を提出し、かつ、その後において連続して確定申告書を提出している場合であって、欠損金の生じた事業年度に係る帳簿書類を保存している場合に限り、適用できる。

^※2018年3月31日までに開始する事業年度において生じた欠損金については、｢9年｣とされる。

青色申告書である確定申告書を提出する事業年度に生じた欠損金額がある場合において、その欠損金額の生じた事業年度（欠損事業年度）開始の日前1年以内に開始したいずれかの事業年度（還付所得事業年度）に、その欠損金額を繰戻して法人税額の還付を請求することができる。還付金額は以下のように計算される。

還付所得事業年度の法人税額 × （欠損事業年度の欠損金額 ÷ 還付所得事業年度の所得金額）

ただし、中小法人以外の法人には、以下に掲げる事業年度において生じた欠損金を除き、1992年4月1日から2020年3月31日までの間に終了する各事業年度において生じた欠損金については、この制度の適用が停止されている。

• 清算中に終了する事業年度
• 解散等の事実が生じた場合における、その事実が生じた日前1年以内に終了した事業年度又はその事実が生じた日の属する事業年度

この制度は、還付所得事業年度から欠損事業年度の前事業年度までの各事業年度について連続して青色申告書である確定申告書を提出し、かつ、期限内に提出した欠損事業年度の青色申告書である確定申告書（期限後申告書を除く。）と同時に「還付請求書」を提出した場合に限り、適用できる。

他の者によりその発行済株式の50％超を直接又は間接に保有される関係（特定支配関係）が生じた日（特定支配日）の属する事業年度（特定支配事業年度）において、その特定支配事業年度前の各事業年度に生じた青色欠損金又は評価損資産を有する法人（欠損等法人）が、その特定支配日以後5年を経過した日の前日までに、たとえば、以下のような事由に該当する場合には、その該当することとなった日の属する事業年度（適用事業年度）以後の各事業年度においては、その適用事業年度前に生じた青色欠損金については、上記1．の青色欠損金の繰越しは適用できない。

• 特定支配日の直前に事業を営んでいない場合において、その特定支配日以後に事業を開始すること。
• 特定支配日の直前において営む事業（旧事業）の全てをその特定支配日以後に廃止し、又は廃止することが見込まれている場合において、旧事業の規模（売上金額等）のおおむね5倍を超える資金の借入れ等を行うこと。
• 上記のいずれかの場合において、その欠損等法人を被合併法人とする適格合併を行うこと。